Esta é a lista dos processos em que Juan de Villalobos atuou como fiscal do Conselho das Índias (sem tradução e encontráveis na documentação disponível no Arquivo das Índias):
1525-09-13 - 1535-06-11: María de Guzmán, viuda de Gil González Dávila, capitán que fue en el descubrimiento del Mar del Sur, contra Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre el pago de los salarios que se le quedó debiendo al dicho su marido.
1527-06-17 - 1544-09-18: Pedro de Salazar, y sus hijos y herederos después, contra los licenciados Francisco Ceynos y Juan de Villalobos, Fiscales del Consejo, sobre el desembargo de cierta partida de oro que trajo de Indias sin registrar.
1528-01-06 - 1538-02-01: Cristóbal de Haro, vecino y Regidor de Burgos, contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre la demasía del valor de las perlas que compró a los Oficiales de la Casa de la Contratación.
1529-08-10 - 1532-03-24: Juan de Villanueva, tenedor de las cosas de la Armada de la Especiería, contra Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre el abono de los gastos que hizo en el viaje de la Coruña a Sevilla para dar recaudo de la hacienda de S.M., así como que se le proveyera de los mantenimientos necesarios para su armada y de sus salarios.
1529-12-15 - 1537-06-05: Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, contra Francisco del Alcázar, Veinticuatro de Sevilla y Tesorero de la Casa de la Moneda de la misma, sobre los derechos de tesorero y ensayador que pretendía cobrar a los mercaderes alemanes que labraban en dicha Casa oro comprado a S.M., con quienes mantuvo pleito por dicha causa en la Casa de la Contratación de Sevilla, y cuya sentencia apeló al Consejo.
1530-02-21 - 1533-08-13: Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, contra Enrique Ynguer y Jerónimo Sayler, alemanes, sobre la pretensión de éstos de cobrar penas a los que pasaren esclavos a Indias sin licencia durante el tiempo de la capitulación que tomaron con la Corona para pasar cuatro mil esclavos, asistiéndoles el derecho de contradicción para que no se diese a otros aquella licencia.
1530-11-12 - 1531-09-14: El licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, contra el licenciado Núñez, Relator del mismo, sobre el valor de los pesos de oro que vinieron de Indias para la madre de éste, Inés de Paz, y que le están mandados pagar por habérseles tomado equivocadamente por el fisco de S.M. como pertenecientes a los que Hernán Cortés, Marqués del Valle, enviaba a su padre, en satisfacción de cierta deuda que éste tenía contraida con la Corona.
1531-01-27 - 1531-01-28: El licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, contra Antonio Ponce, tenedor de los bienes de difunto de la Armada en que fue por Capitán General Sebastián Caboto al río de Solís, sobre la entrega de las cuentas de los dichos bienes.
1533-1534: Pedro López de Bustamente, vecino de la ciudad de Sevilla, con Juan de Villalobos, fiscal de Su Majestad, sobre pago de 6.673 maravedís. Una pieza. 1533-1534
1533-03-10 - 1534-09-25: Isabel García, mujer de Andrés Niño, piloto, contra Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre reclamación del abono de ciertos salarios adeudados al dicho su marido por el desempeño del oficio de piloto.
1533-11-08 -: Juan de Oliver, vecino de Sevilla, por sí y como tutor y curador de los hijos y herederos de Diego de Ribeiro, difunto, contra Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre el cumplimiento del asiento tomado con dicho difunto para la construcción de bombas de metal para las naos, satisfaciendo a sus herederos y al mencionado Juan de Oliver la cantidad anual señalada en el asiento.
1533-11-28 - 1534-04-14: Pedro López de Bustamante, vecino de Sevilla, apela al Consejo la sentencia dictada por la audiencia de la contratación en el pleito que el licenciado Juan de Villalobos, fiscal de la Contratación, le puso sobre la entrega de cierta cantidad. Fecha de inicio: 1533 04 21
1534-04-21 - 1535-01-28: Hernando de Camargo, clérigo, vecino de la Fuentesaúco, contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre el desembargo de cierta cantidad de oro y plata que trajo de Indias sin registrar, y le fue embargada.
1536-12-05 - 1537-09-01: El Comendador García Ruiz de la Mota, Alcalde Mayor de Burgos, como heredero del maestro Pedro Luis de la Mota, Obispo de Palencia, contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre el pago de los derechos y salarios que se le quedaron debiendo al dicho Obispo por todo el tiempo que sirvió como consejero del Consejo de Indias.
1537-02-20 - 1537-03-20: Los herederos del capitán Juan Pérez de Arcilla, difunto, contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre la satisfacción que piden del daño que recibió el dicho capitán en las cuentas de los fletes de su nao "Nuestra Señora de la Humildad", que tomó Luis Fernández de Alfaro, Contador de la Casa, en las que se le quitaron cincuenta pesos, así como en el embargo que le hicieron de la dicha nao por tiempo de ocho días.
1537-08-07 - 1538-01-15: Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, contra Martín de Ynoso, vecino de Orduña, sobre el comiso de cierta cantidad de oro y joyas que trajo de Indias sin registrar.
1538-01-26 - 1538-05-31: María de Vergara, mujer de Pedro de Uribe, e Isabel de Vergara, mujer de Simón Iñiguez, vecinas de Ezcaray, contra Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre la entrega de la herencia de Juan de Vergara, su hermano, fallecido en Indias, que vino por bienes de difunto.
1538-08-23 - 1538-08-30: Pedro de Legarda, vecino de Elgoibar, contra Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre que se exhibiesen el testamento y otras escrituras de Hernando de Legarda, su hermano, difunto en Indias, para que se cumpliesen sus mandas y última voluntad.
1538-09-16 - 1539-08-04: Diego de Fuenmayor contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre la falta de peso que hubo en unas piezas de oro y plata que el dicho Fuenmayor trajo del Perú para S.M.
1539-01-29 - 1539-05-28: Luis Peri, mercader, y Catalina Pugini, su mujer, vecinos de Florencia, contra Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre el abono del monto del juro con que se mandó pagar las partidas de oro secuestradas por la Corona a Bernardo Peri, hijo de los susodichos, difunto, y que no se libró.
1539-05-14 - 1542-03-27: El licenciado Villalobos, fiscal del Consejo, contra don Luis Enríquez de Guzmán, vecino de Sevilla, por no haber pagado los derechos correspondientes al oro, plata y joyas que había traído del Perú Juan de Barrientos, natural de Salamanca destinadas al demandado.
1540  - Protestación hecha por el fiscal de Su Majestad, el licenciado Juan de Villalobos, sobre los diezmos de las Indias concedidos al Rey por bula de Su Santidad.- Cuatro testimonios hechos en Madrid, uno del 8 de enero y tres del 2 de marzo de 1540
1540-07-27 - 1543-04-19: Pedro de Oñate, vecino de la ciudad de Cuzco, contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre la ejecución de los bienes del Adelantado Diego de Almagro, difunto, en la cuantía de la deuda que tenía contraida con el dicho Pedro de Oñate, en virtud de una claúsula contenida en su testamento.
1540-09-02 - 1541-07-13: El licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, contra el capitán Hernán Ponce de León, vecino de Sevilla, y Diego Núñez de Mercado, vecino de Madrigal, sobre la ejecución de sus bienes por la cuantía del oro y plata que trajeron de Indias sin registrar en los últimos años.
1540-09-06 - 1541-10-26: Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, contra Diego de Toledo, Prior de la Orden de San Juan de Jerusalén, en nombre de dicha Orden, sobre el comiso de cierta cantidad de oro y plata que el bachiller fray Martín, profeso de la misma, había traido de Indias sin registrar.
1540-09-07 - 1540-11-05: El licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, contra Antonio de Saldaña, vecino de Toledo, sobre el comiso de cierta cantidad de oro que trajo de Indias sin registrar. 8 folios
1540-09-23 - 1541-09-02: El licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, contra Alonso Enríquez de Guzmán, sobre el comiso de cierta cantidad de oro y plata que trajo de Indias sin registrar.
1540-12-23 - 1561-03-29: El licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, contra el capitán Hernán Ponce de León, vecino de Sevilla, sobre el comiso de cierta cantidad de oro y plata que trajo de Indias sin registrar.
1541-03-04 - 1541-12-17: Proceso de recusación interpuesta por Blas de Saavedra, Secretario del Consejo, en nombre de sus hijas y de Beatriz de Dueñas, su suegra, viuda de Alonso Jiménez y vecina de Oropesa, contra el doctor Bernal de Luco, Consejero de Indias, en el pleito que ésta trata con el Licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre los bienes que quedaron del Mariscal Rodrigo Orgoños, difunto, como su heredera. Acompaña proceso original sobre los susodichos bienes de difunto, actuado ante el Consejo.
1541-03-08 - 1541-03-18: Gaspar de Astudillo, Veedor de la Real Hacienda, contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre el abono de los salarios que le corresponden del tiempo que estuvo suspendido en el dicho oficio.
1542-03-21 - 1547-12-19: La mujer e hijos de Domingo de Cornoza, difunto, contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre concesión de nueva licencia para pasar cierto número de esclavos a Indias en cabeza de quien ellos designaren, al no haberse llevado a efecto la licencia otorgada al dicho difunto, por la que había pagado los correspondientes derechos.
1542-04-22 - 1542-05-22: El licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, contra Antonio de Herrera de Oviedo, sobre el comiso de cierta cantidad de plata que trajo de Indias sin registrar.
1543-07-19 - 1544-03-24: El licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, contra el capitán Jorge de Robledo, sobre los daños y malos tratos que hizo a ciertos indios de Perú.
1543-07-27 - 1547-10-13: Ana Ruiz, viuda de Hernando de Argüello y vecina de la Torre de Mormojón, contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre la entrega de la mitad de los bienes del dicho su marido.
1543-08-20 - 1543-08-23: Nicolás de Lezo, maestre, contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre el abono de las raciones de la gente que fue en la Armada de la Guarda de la costa de Andalucía, que pagó a su costa.
1543-12-03 - 1544-09-11: Juan de Aguirre, maestre de la nao capitana de la Armada de que fue por Capitán General Martín Alonso de los Ríos, por sí y en nombre de los demás maestres que sirvieron en dicha Armada, contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre el pago de los fletes de sus navíos a mayor precio de lo acostumbrado en otros viajes, por los trabajos y gastos que tuvieron en prepararlas para la dicha Armada.
1544-02-18 - 1544-11-24: El licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, contra Diego de Gálvez, sobre el comiso de cierta cantidad de oro y plata que trajo de Indias sin registrar.
1544-04-05 - 1544-04-24: Beatriz de Dueñas, viuda de Alonso Jiménez y vecina de Oropesa, como madre y heredera del mariscal Rodrigo Orgoños, difunto, contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, y Diego Méndez, vecino y Regidor de la ciudad del Cuzco, sobre los bienes del dicho difunto.
1544-04-22 - 1544-10-22: El licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, contra Juan Sánchez Carrillo, vecino de Ciudad Real, sobre la libertad de Pedro, indio, al que éste había comprado por su esclavo sin que tuviese título de servidumbre.
1544-04-29 - 1544-08-07: El licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, contra Esteban Vicente, vecino de Medina del Campo, sobre la libertad de Magdalena y María, indias, a las que éste había hecho esclavas siendo libres.
1544-05-27 a 1544-06-06: contra Juan de Villalobos, vecino de Vélez-Málaga;
1544-12-19 - 1553-03-02: Leonor de Toro, viuda de Pedro Caballero, y demás consortes, contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre los bienes de Hernando de Toro, su hermano, difunto en Perú.
1545-03-04 - 1545-05-05: Antón de Oquendo, marinero, vecino de San Sebastián, contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre la devolución del valor que importaron cierta cantidad de remos, pez y anclas que llevó consigo a Indias como enseres necesarios para la navegación, y que le fueron decomisados por no haberlos manifestado en la Casa de la Contratación.
1545-03-06 - 1545-05-06: Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, contra Juan de Cartagena, boticario, vecino de Medina del Campo, sobre la libertad de Pedro, indio, a quien éste tenía por su esclavo.
1545-03-28 - 1545-05-29: Hernando Pizarro contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre la expedición de una Real Cédula para que no se le quiten los indios que tiene encomendados, en razón de haber sido Teniente de Gobernador en Indias. 4 folios
1545-05-05 - 1547-03-12: Pedro Márquez, vecino de Sanlúcar de Barrameda, contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre concesión de licencia para pasar a Indias ocho esclavos negros en lugar de otros tantos que murieron en el mar.
1545-05-06 - 1547-03-21: Pedro de Ibarluz, vizcaino, escribano del galeón Santa María, contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre la devolución del depósito que le impusieron el gobernador y justicias de la isla de Cuba por llevar una caja de mercancías sin registrar, habiendo pagado los derechos correspondientes.
1545-05-18 - 1546-06-22: Juanes de Semper, natural de Francia y vecino de Pasajes, y Pedro de Gamboa, navarro, vecino de Guipúzcua, contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre el levantamiento de la condena a galeras que les había sido impuesta por haber sido tomados por franceses en la isla Española.
1545-05-30 - 1546-09-11: Leonardo Lomelín y Tobías de Marín, genoveses, contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre el cumplimiento de la licencia que tenían otorgada para pasar cierto número de esclavos a a Indias.
1545-07-01 - 1550-03-17: Rodrigo Bazo, Almojarife Mayor del Almojarifazgo de las Indias, contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre el pago del dos y medio por ciento de los derechos de almojarifazgo de las mercancías que se llevan a Indias sin registrar.
1545-09-03 - 1545-12-10: Isabel Navarro, viuda de Cristóbal de Illescas, vecina de Vélez-Málaga, contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre la entrega de una certificación por los Oficiales de la Casa, en cumplimiento de cierta Real Cédula, de la cantidad que le fue tomada a Pedro Navarro, su hermano, para servicio de S.M.
1545-10-08 - 1546-03-06: El licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, contra el capitán Alonso de Alvarado y contra Cristóbal de Barrientos, Juan Marroquín, Juan, Diego y Gonzalo de Alvarado y otros sus consortes, sobre ciertas cartas y avisos que los dichos Alonso de Alvarado y Cristóbal de Barrientos, presos en la corte, habían entregado a los citados consortes, dirigidas a ciertas personas sospechosas en el servicio de S.M. que residían en Perú.
1546-01-09 - 1562-05-25: Juan de Sámano, Secretario de S.M., contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del mismo, sobre la ejecución de los bienes del licenciado Cristóbal Vaca de Castro, del Consejo de S.M., en la cuantía de la deuda que tenía contraida con él en razón de la renuncia que hizo de la escribanía mayor de la gobernación de la provincia de Nueva Toledo, en el Perú. Corre unido a la demanda presentada por otros acreedores de los bienes del licenciado Vaca de Castro.
1546-03-26 -: Información y probanza hecha en Lisboa presentada por el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, para el pleito que trata con el licenciado Cristóbal Vaca de Castro, sobre cierta cantidad de oro, plata y esmeraldas que trajo desde Indias a Portugal sin registrar. La fecha es la del traslado de la probanza.
1546-05-07, (Madrid)  - Real Cédula a los oficiales de la Casa de la Contratación para guarden y cumplan los autos pronunciados en el pleito seguido entre Juan Galvarro, vecino de Sevilla, y el licenciado [Juan de] Villalobos, fiscal del Consejo de Indias, sobre los 4.092 pesos de oro que envió consignados a aquél Hernando de Carmona desde Tierra Firme
1546-05-31 - 1546-09-15: Los hijos del capitán Gómez de Tordoya, difunto, contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre la entrega de los indios que tenía encomendados dicho capitán en el Perú, en remuneración de los servicios prestados a S.M. por el mismo.
1547-03-18 - 1550-01-23: Nicolás de Aramburu, vecino de Azcoitia, como cesionario de Martín de Arauco, contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, y el licenciado Cristóbal Vaca de Castro, sobre el cumplimiento de una obligación hecha por este último para satisfacer la deuda que tenía contraida con el dicho Martín de Arauco.
1547-07-05 - 1551-03-21: El licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, contra Vicencio Pablo, preso en la Corte, hijo de Pablo de Monguía, sobre una muerte que hizo en la provincia de Quito.
1547-07-12 - 1547-07-21: Francisco Rodríguez Calderero, vecino de Moguer, contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre la entrega del sueldo de Antón Rodríguez Calderero, marinero, padre del anterior, por el tiempo que sirvió en la Armada que se envió al Maluco.
1547-08-27 - 1547-11-26: El licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, contra Diego de Fuenmayor, vecino de Yanguas, sobre que se ejecutase la obligación que éste había hecho de pagar cierta cantidad en que fue alcanzado al tomársele las cuentas del oro y plata que trajo de Indias para S.M. en la armada de Blasco Núñez Vela.
1547-11-16, (Monzón): Real Cédula a los oficiales reales de Tierra Firme, a petición del licenciado Juan de Villalobos, fiscal del Consejo de Indias, para que averiguen y manden razón de todo el oro, plata, piedras y otras cosas de la real hacienda que tanto ellos como otras personas hubieran entregado al contador Agustín de Zárate.
1548-01-28 - 1550-09-13: El licenciado Juan de Villalobos, fiscal del Consejo, presenta ante el mismo el pleito hecho de oficio contra Dionisio Molón, francés, ante la justicia de la ciudad de Cádiz, sobre la libertad de cuatro indios que dijo haber comprado en Cádiz. Fecha de inicio: 1547 10 26 113 folios. Incluye traslado del proceso actuado en la Audiencia de la Contratación
1548-04-11 - 1560-07-12: Proceso actuado en el Consejo entre Francisca de Villafañe, viuda de Diego de Mendoza, por sí y en nombre de sus hijos, vecinos todos de Marbella, por una parte, y Juan Vázquez Orejón, vecino de Morón de la Frontera, y el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, por otra, sobre cumplimiento de ciertas requisitorias otorgadas por los jueces de la Audiencia de la Contratación en el pleito que la citada Francisca de Villafañe ha seguido contra los herederos de Pedro de Mendoza sobre cobranza de ciertos bienes de éste. Inserta una primera presentación ante el Consejo de Francisca de Villafañe con el pedimiento de los bienes de Pedro de Mendoza, remitida a la Casa de la Contratación, y el traslado del proceso actuado en la Audiencia de la misma. Fecha de inicio: 1537 11 20
1548-06-14 - 1555-08-13: El licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, contra María de Mendoza, viuda de Francisco de los Cobos, Comendador Mayor de León y Contador Mayor de Castilla, y Diego de los Cobos, su hijo, Marqués de Camarasa, Comendador Mayor de León y Adelantado de Cazorla, herederos del anterior, sobre la devolución de los derechos del oficio de Fundidor y Marcador Mayor de las Indias que llevó el dicho Francisco de los Cobos a la hacienda real.
1549-01-21 - 1549-04-16: Juan de Tordesillas, en nombre y como padre de Juan Díaz de Tordesillas, preso en la Cárcel de la Contratación, contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre el cumplimiento de la condena a galeras en que fue sentenciado el dicho su hijo.
1549-01-29 - 1551-09-07: Juan Martínez de Ribera, vecino de Sanlúcar de Barrameda, preso en la cárcel de la Contratación, contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre el cumplimiento de la condena a galeras en que fue sentenciado en la Ciudad de los Reyes.
1549-02-05 - 1551-02-18: El licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, y Catalina de Velasco, india, contra Inés de Pimentel y Fadrique Osorio de Toledo, Marqueses de Villafranca, sobre la libertad de dicha india.
1549-02-14 - 1549-03-27: El licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, contra Brianda Acuña, viuda de Blasco Núñez Vela, y demás herederos de éste, sobre la entrega del libro de las cuentas de la Armada de la que fue por Capitán General el dicho Blasco Núñez Vela.
1549-02-25 - 1551-03-14: El licenciado Villalobos, fiscal del Consejo, apela al mismo la sentencia dictada por los jueces de la Contratación en el pleito que pusieron al capitán Rodrigo Niño, vecino de la ciudad de Toledo, por no haber entregado en Sevilla a unos presos que traía del Perú para servir en galeras, así como cierta cantidad de oro y plata que trajo fuera de registro. Fecha de inicio: 1549 01 04
1549-03-08 - 1550-08-28: Francisca López, viuda de Antonio Criado Morejón, vecina de Ontiveros, y el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, contra Pedro Pérez, mercader, vecino de Sevilla, sobre la acusación de haber dado éste muerte al dicho Antonio Criado en la ciudad de Nombre de Dios.
1549-03-13 - 1551-12-04: Luis Zapata de Avalos, Arcipreste de la villa de Medellín, y otros sus consortes, como fiadores que fueron de Juan de Sanabria, Gobernador del Río de la Plata, contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre la ejecución de sus bienes en cumplimiento de la fianza que hicieron de cierta capitulación que se tomó con el citado Juan de Sanabria.
1549-06-03 - 1550-03-03: Hernando Pizarro, preso en la Mota de Medina del Campo, contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre la devolución de ciertas escrituras que el el licenciado Martín Bermúdez, Corregidor de la dicha villa de Medina del Campo, le había tomado de un arca de su aposento.
1549-07-16 - 1550-07-03: Andrés de Paredes, Melchor Barreto y Alonso de la Barrera, vecinos de Lisboa, contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre concesión de nueva licencia para pasar a Indias treinta esclavos en lugar de otros tantos que murieron en el mar. 83 folios
1549-11-20 - 1550-06-21: El licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, contra Pedro Quiralte, vecino de Alcaraz, sobre la falsificación que había hecho de una cédula concediendo licencia para pasar a Indias.
1549-11-26 - 1551-01-12: El licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, contra Juan Osorio, vecino de la villa de Arévalo, y Gutiérrez de Cárdenas, vecino de Medina del Campo y hermano de Francisco de Cárdenas, condenado a muerte en el Perú y a la confiscación de todos sus bienes por traidor y seguidor de Gonzalo Pizarro, sobre el secuestro de ciertos bienes de ambos, tomados como pertenecientes al dicho Francisco de Cárdenas.
1549-12-20 - 1550-01-15: Lamberto de Cuenca, vecino de Zaragoza, preso en la Corte, contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre la pretensión de vender supuestas licencias para pasar a Indias.
1550-02-10 - 1550-04-29: Martín de Urnieta, vecino de San Sebastián, maestre de la nao 'Santa María', contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre el abono de sus sueldos y de los daños y perjuicios ocasionados por el embargo de la dicha su nao. 20 folios
1550-03-13 - 1570-05-27: Juan de Villalobos, fiscal del Consejo, apela al mismo la sentencia dictada por los jueces oficiales de la Casa de la Contratación en la que absuelven a Francisco Ruiz Damiel, vecino de la Nava de Medina, y preso en la cárcel de la Contratación, de su condena a galeras por haber participado en la rebelión de Gonzalo Pizarro. Fecha de inicio: 1549 09 20 115 folios. Incluye traslado del proceso actuado en la audiencia de la Contratación
1550-04-21 - 1550-07-21: El Mariscal Diego Caballero, vecino y Veinticuatro de Sevilla, contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre la licencia de dos esclavos que le fueron embargados en Indias por ir de más de los que había registrado. 9 folios
1550-05-08 - 1562-04-30: El licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, contra Francisco Lobo, vecino de la villa de San Miguel (Perú), y otros herederos de Bartolomé de Aguilar, difunto, natural que fue de Trujillo, en Extremadura, quien fue condenado en perdimiento de todos sus bienes por rebelde y traición en la ciudad de Cuzco, sobre el secuestro de un Juro que tenía situado dicho difunto en la villa de Montánchez.
1550-05-10 - 1550-07-18: Juan García Samames, hijo de Luis García Samames, difunto, y de Marina Rodríguez, vecinos de Palos de la Frontera, contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre la entrega de los indios que tenía encomendados el dicho su padre en Perú, así como de la remuneración de los gastos que hizo en el real servicio.
1550-05-14 - 1552-11-23: El licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, contra Miguel de Aramburo, mercader vizcaino, vecino de Sevilla, sobre el cumplimiento de cierta capitulación y contrato que había hecho con S.M. para aprovisionar y enviar de armada las carabelas 'Magdalena' y 'Guadalupe', propiedad de su compañía, en socorro del Río de la Plata, llevando en ellas gente y mercaderías.
1550-05-21 - 1554-01-23: El licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, contra el licenciado Francisco Alanís de Paz, provisto por Juez y Alcalde Mayor del Río de la Plata, sobre la devolución de cierta cantidad que le dieron los oficiales de la Casa de la Contratación a cuenta de sus salarios, por no haber podido pasar a servir dicho oficio.
1550-06-14 a 1550-09-01: feitor Diego de Mercado contra o fiscal Juan de Villalobos: Iñigo López de Mondragón, en nombre del Factor Diego de Mercado, contra el licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, sobre la entrega de ciertas escrituras que el Adelantado Diego de Almagro envió con el capitán Juan de Espinosa para comprar ciertos juros y rentas en la ciudad de Jerez de la Frontera, y que el dicho Diego de Mercado necesita presentar en el pleito ejecutivo que trata en el Consejo con el fisco real y con Blas de Saavedra, escribano de Cámara. Comprende:
1551-07-26 - 1551-08-27: El licenciado Juan de Villalobos, Fiscal del Consejo, contra Carlos Enríquez y demás herederos del capitán Gaspar Rodríguez de Camporredondo, difunto, natural y vecino que fue de Sahagún, sobre el pago de cierta deuda que tenía éste contraida con S.M.